發現數百種潛伏在海洋中的神秘巨型病毒
科學家們剛剛發現了數百個新的巨人病毒,這是一項涵蓋全球海洋的綜合研究。
這項研究背后的團隊,來自邁阿密大學的海洋生物學家本杰明·明奇 (Benjamin Minch) 和病毒學家穆罕默德·莫尼魯扎曼 (Mohammad Moniruzzaman) 使用定制的計算機軟件來識別基因 組海水樣本中的微生物 – 包括 230 種以前不為科學所知的巨型病毒。
識別這些病毒是理解的關鍵部分海洋生物,特別是海洋生物的生存原生生物– 包括藻類、變形蟲和鞭毛蟲。
“通過更好地了解巨型病毒在海洋中的多樣性和作用,以及它們如何與藻類和其他海洋微生物相互作用,我們可以預測并可能管理有害的藻華,這對佛羅里達州以及全世界的人類健康構成危害,”說莫尼魯扎曼。
得益于基因組數據庫、分析儀器和計算機程序(例如此處使用的計算機程序)中,發現巨型病毒的過程現在比以前容易得多——這讓科學家們對這些病毒的傳播和行為有了新的了解。
例如,巨型病毒通常是導致浮游植物,一種常見于海洋、湖泊和河流中的微小光合作用生物。這些生物對海洋生物和食物鏈至關重要,并產生大量的 Eartyh 氧氣,因此更多地了解捕食它們的病毒可能有助于保護工作。
除了 230 種新的巨型病毒外,該研究還確定了 569 種新的功能性蛋白,其中包括 9 種參與光合作用的蛋白。似乎在某些情況下,病毒能夠劫持光合作用功能為了獲得生存所需的能量。
“我們發現巨型病毒具有參與細胞功能的基因,例如碳代謝和光合作用——傳統上只存在于細胞生物中,”說明奇。
“這表明巨型病毒在感染期間縱宿主的新陳代謝和影響海洋生物地球化學方面發揮著巨大的作用。”
研究人員能夠將他們發現的巨型病毒擬合到兩個現有的病毒訂單:Imitervirales 和 Algavirales。這些群體使用不同的感染策略,其中 Imitervirales 的遺傳最復雜,表示一種更靈活的 “life strategy”,可能允許病毒在更廣泛的宿主中生存。
我們知道,在全面了解生活在海洋中的生命時,我們才真正觸及了表面:每一滴海水都是病毒泛濫,而海洋生物實際上也有幫助保護我們免受許多.
使用這項特定研究中概述的方法,也應該會有更多的工作。仍然存在大量的病毒等待被發現并編目——并與海洋生態系統和健康放在一起。
“這項研究使我們能夠創建一個框架來改進現有的新型病毒檢測工具,這可能有助于我們監測水道中的污染和病原體。”說明奇。
該研究已發表在Nature npj 病毒.